Pondok Pesantren Khairul Ummah merupakan salah satu pondok pesantren yang ada di Provinsi Riau, berlokasi di desa Batu Gajah kecamatan Pasir Penyu kabupaten Indragiri Hulu. MTs Khairul Ummah merupakan salah satu unit lembaga pendidikan yang berada dibawah naungan Yayasan Islam Indragiri (YASIIN). Ponpes Khairul Ummah berdiri pada tahun 1996, dengan sistem kurikulum mengacu pada Kementerian Agama. MTs Khairul Ummah juga merupakan madrasah berbasis Pesantren, dimana para siswanya tinggal di Asrama. Adapun yang menjabat sebagai kepala MTs Khairul Ummah pertama adalah KH. Munashir Jufri (alm), beliau juga selaku pimpinan Pondok Pesantren Khairul Ummah.

Adapun kegiatan belajar santri ada 2 jenis kegiatan yaitu kegiatan belajar mata pelajaran sekolah dan mata pelajaran pondok. Untuk mata pelajaran sekolah disesuaikan dengan kurikulum dari Kementerian Agama, sedangkan mata pelajaran pondok yang disajikan yaitu Muthola’ah, Mahfuzhat, Imla, Nahwu, Shorof dan Kitab Kuning (Kutubut Turats)