Markazul Qur’an memiliki program Yayasan Karantina Tahfidz Nasional atau yang dikenal dengan YKTN dengan harapan mencetak generasi-generasi penerus yang islami. Implementasi sekaligus aktualisasi nilai-nilai Al-Qur’an dalam kehidupan, tidak akan terwujud dengan sendirinya tanpa ada kesungguhan untuk mengusahakannya. Al-Qur’an tidak akan mampu memberikan manfaat secara konkret tanpa adanya usaha yang sistematis dan terorganisir dari umat islam itu sendiri.

Mempelajari Al-Qur’an memiliki nilai-nilai yang penting diantaranya:

• Menanamkan nilai-nilai keagamaan.
• Membentuk karakter dan moral.
• Mengajarkan ilmu Al-Qur’an seperti tajwid, tahsin, dan qiraat.
• Memahami ilmu islam lainnya seperti hadits, tasawwuf, dan fiqh.